Родился 4 сентября 1996 года в с. Первотаровка Исилькульского района. В 2012 году, окончив 9 классов МБОУ «Первотаровская средняя общеобразовательная школа», поступил в БПОУ «Исилькульский профессионально-педагогический колледж» по программе «Сварщик ручной и частично механизированной сварки (наплавки)».

В 2015 году был призван на срочную военную службу в ряды Российской Армии. Служил в воздушно-десантных войсках.

24 сентября 2022 года был призван на военную службу по мобилизации, 10 февраля 2023 года был отправлен в зону специальной военной операции на Украину.

27 апреля, выполняя с честью свой воинский долг, рядовой Козлов Сергей Евгеньевич героически погиб в ходе проведения специальной военной операции.

Указом Президента РФ за доблесть, отвагу и самоотверженность, проявленную в ходе проведения СВО, награждён посмертно орденом Мужества.

12 мая 2023 года с воинскими почестями похоронен на кладбище в с. Первотаровка Исилькульского района.